Comparación De Alineación De Arn Seq Ensayos


Encontrado 340860 ensayos.

Informe sobre transcriptómica de RNA-SEQ

Argonaute Clip-Seq detecta el ARN asociado Argonaute para predecir los objetivos de la MIRNA, mientras que BRIC-SEQ se usa para medir la vida media de las transcripciones de ARN.Figura 1: Experimento de ARN-SEQ: Conversión de los ARN largos al cDNA y la fragmentación.Alineación y clasificación de lecturas para referencia genoma o transcriptoma.Como resultado, se regularon los genes de tubule 1322 en comparación con los genes de toda la totalidad, mientras que 1557 se regularon con bajada.Alineación visual de la muestra TB1 .


2831 palabras (7,1 paginas)
Entendiendo una secuencia de proteínas desconocidas

Se utilizó una herramienta de alineación múltiple para buscar proteínas con similitudes con la proteína predicha.Figura 2: (a) PSI-BLAST Muestra un índice de similitud a la secuencia de consulta (B) RESULTADOS CLUSTALW2 que muestran la alineación entre la proteína predicha (SEQ ID: GI | 168001481 | REF | XP_001753443 .1) y proteína predicha (SEQ ID: GI | 168035394 | Ref | XP_001770195.1).Figura 3: (a) muestra el árbol de distancia y la posición de la proteína de la consulta, también resalta otras proteínas predichas en (b) muestra las herramientas de alineación basadas en la restricción que muestran varias otras proteínas que tienen similitudes entre ellos y La proteína de la consulta.Una búsqueda Ejecutar en Propsearch, que busca la fam...


3143 palabras (7,9 paginas)
Nivel de expresión de transcripción de peso nocturno blanco

El ARN se extrajo de los tejidos recolectados y se preparó adicionalmente para la construcción de la biblioteca de ADNc (HO, 2014).RNA-SEQ se aplica ampliamente en el estudio científico porque puede dar una imagen más clara y más comprensiva sobre los transcriptomas en comparación con la microarray de ADN y el análisis en serie del enfoque de expresión génica (SAGE).Se realizan la preparación antes de análisis, como la recolección de muestras, el aislamiento de ARN, la construcción de la biblioteca de ADNc, la secuenciación y el mapeo.La comparación de la expresión génica entre muestras se puede determinar directamente una vez que se use RPKM.Se obtendrán datos de análisis de alto rendimiento para mejorar la calidad de los datos genético...


2352 palabras (5,9 paginas)
Predicción de CRM y enfoques de validación de CRM

Con la alineación de la secuencia de ADN entre las especies ortólogas, las secuencias de ADN cortas que se conservan en muchas especies, a saber, las huellas filogenéticas, podrían ser los posibles sitios de unión para los factores de transcripción [164, 165], y las mutaciones de las cajas conservadas pueden llevar a la reducción del gen. Expresión como en el ejemplo del efecto alterado de la caja de Variant E en la inducción de genes de ε-globina [166].Esta predicción les permitió distinguir 40,000 CRMS del genoma y la tasa de validación fue relativamente considerable en comparación con el enfoque epigenético [178].El prometedor módulo transcripcional específico del hígado de la predicción se validó y mostró aún más la actividad notable...


3558 palabras (8,9 paginas)
Efectos de alineación de la novela Secuencial-Presentation-Solamente (SPO)

En condiciones presentes objetivo, se planteó la hipótesis de que (a) la alineación secuencial producirá menos hits y falsas alarmas que la alineación simultánea y (b), la alineación de SPO producirá menos alarmas falsas que la alineación simultánea Sin una reducción significativa en los hits.Esto explica la tasa alta en la alineación simultánea y las bajas tasas de alarma falsas en comparación con la condición secuencial.Se les instruyó a los participantes que respondieran con 1 a 5 que indican el miembro de alineación que pensaron que era el objetivo o a responder 6 si el objetivo no estaba presente en la alineación.Se les instruyó a los participantes que respondieran con 1 a 5 que indican la alineación de 7 miembros que pensaron que e...


3148 palabras (7,9 paginas)
Priorizando los objetivos de los medicamentos para los medicamentos antipalúdicos

2002, (6906): 527-31. .Según la investigación relacionada, la vinculación de ATP contiene procesos biológicos, incluida la translocación de varios sustratos a través de membranas y procesos no relacionados con el transporte, como la traducción de la reparación de ARN y ADN, que necesitan la energía del trifosfato de adenosina (ATP).2004, (1): 1-11. .KIMATA AY, KURISU G, KUSUNOKI M, AOKI S, SATO D, KOBAYASHI T, KITA K, HORII T, T-Cloning y Caracterización de Ferredoxin y Ferredoxin-NADP + Reductasa del parásito de la malaria humana, j Biochem.\ 2011, 280 (1-2): 19-26. .


2299 palabras (5,7 paginas)
Controlando la pausa POL II

La secuenciación de ARN tercero, corta y corta (SCRNNNA-SEC) detectó 25-60 nt transcripciones generadas a partir de POL II en pausa en Drosophila (Nechaev et al., 2010).La proteína ZLD se puede detectar en núcleos de embrión tan pronto como NC 2, cuyo nivel aumenta y alcanza en gran medida al NC 10, coincidiendo con ZGA, luego disminuye gradualmente (Harrison et al., 2010; Kanodia et al., 2012; Nien et al.ZLD ARNm se carga maternalmente de las células de la enfermera en el ovario, y se distribuye uniformemente en el embrión, excluyendo PGC hasta la celularización, cuando ZLD depositado maternalmente se reemplaza por ZLD transcrito cigóticamente (Liang et al., 2008; Staudt et al., 2006).Está presente ubicuamente en los embriones tempranos...


2713 palabras (6,8 paginas)
Análisis de gata3 chip-seq en las cuatro celdas

Sugerimos ER1, FOXA1, AKR1C1, y LGALS podría desempeñar un papel importante en la acción regulatoria de GATA3 en las células tumorales.Luego, los datos GATA3 FIP-SEQ se sometieron a una comparación de pares e identificación del sitio de enlace GATA3.Sin embargo, debido a una gran cantidad de genes objetivo GATA3 específicos en las cuatro células tumorales, no pudimos encontrar el mecanismo reglamentario específico en las cuatro células tumorales.Luego, realizamos la comparación de pares de los datos de GATA3 CHIP-SEQ e identificamos el sitio de encuadernación de GATA3.Además, el enriquecimiento significativo del motivo "GAT" indicó que "GAT" podría desempeñar un papel importante en la identificación y la combinación de GATA3 y ADN.


3318 palabras (8,3 paginas)
Codificación de RIP de Elaeis Guaneensis Jacq

Una regulación importante significativa de la expresión génica en comparación con el control negativo no tratado.a) Los residuos de nucleótidos que se conservan altamente conservados se resaltan en gris; Los guiones representan las brechas introducidas para maximizar la alineación.Cuando la ANOVA fue significativa en 0.05, la prueba de rango múltiple de Duncan se usó para la comparación de medios.Las cantidades iguales de ARN (1UT) extraídas del control y las muestras de raíz de palma de aceite tratadas se convirtieron en ADNN utilizando el kit de transcripción inversa de dos pasos OmnisScript para la síntesis de ADNc (QIAGEN, EE.Además, la palma de aceite tiene la mayor producción de petróleo (aceite por unidad de tierra) en comparación...


2610 palabras (6,5 paginas)
Ensayo de alineación de secuencia

Para lograr una alineación múltiple, es necesario generalizar la noción de una función de puntuación definida anteriormente para dos secuencias.consiste en calcular la puntuación de similitud, clasificando las secuencias más similares y luego haciendo una alineación final.De hecho, simplemente comparamos simplemente los aminoácidos o los nucleótidos en pares, pero dentro de una columna de alineación múltiple.Los métodos de alineación pueden intentar alinear secuencias durante toda su longitud, esto se llama alineación global, o se restringe a regiones limitadas en las que la similitud es fuerte, para excluir el resto de las secuencias, entonces hablamos de alineación local.La alineación múltiple permite, entre otras cosas, identificar re...


1635 palabras (4,1 paginas)
Estrategias de secuenciación genética

Compararon personalizar secuencias para producir una matriz de puntajes de alineación por pares.El programa Clustal incluye Clustalw2 y Clustal X2, generalmente se usa para producir una alineación múltiple optimizada.La alineación se puede mejorar introduciendo una brecha adicional en una de las secuencias, en lugar de tomar una alineación de secuencias como un absoluto, a fin de ayudar a la formación de relaciones evolutivas.Al identificar los sitios de aminoácidos en la estructura 3D de las proteínas, podemos distinguir si la alineación se produce en una región vital para la función de la proteína.Debido a la similitud, dos secuencias similares se alinean juntas para generar un nuevo consenso hasta que todas las proteínas en una alinea...


2443 palabras (6,1 paginas)
Heterogeneidad molecular del virus del moteado del clavel en Irán

RT se realizó en un volumen de reacción de 20 l que contiene 1x tampón RT, 10 mM DNTP, cebador de inversión de 22 mm (CarMVCPD 5ï, ¢ -CTGCAGTCACATCCTATAAACAAC-3ï, ¢), 1 inhibidor de ribonucleasa U / L (FERMENTAS), 10 U / ï l de M-MULV transcriptasa inversa, y 5-7 μl de ARN total a 42 ° C durante 1 h. La amplificación de la reacción de la cadena de la polimerasa (PCR) se realizó después de la síntesis de ADNc en una reacción de 50 ï L que contiene 1x tampón de PCR (KCl de 500 mm; 200 mm TRIS-HCl, pH 8,4), 1,5 mm MgCl2, 200 m DNTP, 0,3 m de cada uno Adelante (CarmvCPU: 5ï, ¢ -ggatcccgtatggaaaaAtaAggag-3ï) y cebadores inversos, 2 u de ADN polimerasa Taq y ADNc de 1L.La alineación de la secuencia múltiple mostró una identidad del 100% entre ...


2664 palabras (6,7 paginas)
Ensayo de técnicas de comparación del genoma

Es un programa que realiza una alineación local entre dos secuencias nucleicas o proteicas.Si es así, podemos deducir en comparación, algunos de los datos experimentales recopilados de esta manera a la nueva secuencia.El paradigma de flujo de datos de instrucciones único (SIMD) se usa en gran medida en esta clase de procesadores, lo que la hace adecuada para aplicaciones de datos paralelas, como la alineación de la secuencia.Para acelerar los métodos de alineación de la secuencia, se implementan en varias plataformas de hardware disponibles, lo que promete enormes ganancias de rendimiento.Al aprovechar el despacho de instrucciones SSSE Extension SIMD instalado en los procesadores modernos, el tiempo para completar los análisis se reduce ...


3649 palabras (9,1 paginas)
Genes y mecanismos en el cáncer colorrectal (CRC)

En nuestro estudio, AQP8 se expresó sobrepresamente en muestras de CRC, lo que sugiere que puede inhibir el desarrollo de CRC.Sin embargo, todavía se necesitan estudios adicionales para confirmar nuestros resultados.informó que AQP8 se expresó principalmente en tejidos normales paraneoplásticos y apenas expresado en células CRC [39].La secreción de la bilis de su camino relacionada puede ser potenciales mecanismos patógenos de CRC.En conclusión, nuestro estudio muestra que la interacción del receptor de citoquinas-citoquinas, la vía de señalización de TNF y las funciones de secreción de bilis pueden estar estrechamente relacionados con el desarrollo de CRC.


2689 palabras (6,7 paginas)
ERG11 en resistente a los medicamentos de C. krusei

Para el análisis de PCR cuantitativo en tiempo real, el ARN total se extrajo de los cultivos con un kit RNAISO de levadura (Takara, Dalian, China) y se transcribió reversiblemente a ADNNA con la mezcla maestra de RT Primscript (Takara, Dalian, China) de acuerdo con las instrucciones del fabricante.De acuerdo con los estudios anteriores, nuestros resultados reflejaban que se encontró que el nivel de transcripción del ARNm fue significativamente mayor en las cepas resistentes a la ITR en comparación con las cepas susceptibles de ITR.El MIC se definió como la concentración del fármaco que redujo el crecimiento de los hongos en un 80% en comparación con el cultivado en ausencia de la droga.En conclusión, se observaron sustituciones de codone...


2431 palabras (6,1 paginas)
Cambios en el gen de la influenza A (H3N2) de la influenza estacional (H3N2) NS

Aisla el aminoácido en la posición indicada en la proteína NS1 .Las secuencias de genes NS de 32 cepas de virus de influenza A / H3N2 aisladas en este estudio de 90 secuenciaron se seleccionaron la base en el sitio de la recolección de muestras, en comparación y analizada con la tensión de la vacuna y las secuencias obtenibles de otros países en el hemisferio norte ya depositado en Genbank.1 1 1 1 1 1 2 2 2 .La proteína NS1 está hecha de dos dominios importantes: el dominio de unión automático de ARN terminal N-terminal (1-73) y el dominio efector de Terminal C-terminal (73-237) residuos.La extracción de ARN se realizó con un kit de extracción de ácido nucleico viral alto (Roche Diagnostic, Alemania) según el protocolo del fabricante.


1876 palabras (4,7 paginas)
Organización Mitocondrial Gene

filogenética utiliza MTDNA al examinar las conexiones a nivel de especies y a partir de los taxones tardíos (Hebert 2003).Hale y Singh (1986) también han informado la variación de longitud extrema en la región de control de esto sugiere que se debe tener cuidado con la alineación y se necesita pruebas significativas para distinguir entre las coincidencias y la homología aleatorias (Simon., 1994).ribosomas son un complejo grande de ARN y proteínas, el ARN Cataliza la síntesis de proteínas.Sin embargo, la velocidad enérgica de la evolución hace que el MTDNA sea tan valioso para las divergencias recientes, se vuelve problemático cuando se examinan las divergencias que se datan con el mesozoico o antes se examinan (Mitchell, 2008).Las molécu...


2246 palabras (5,6 paginas)
Caso Breve - Del Monte Fresh Produce Company v. Dole Food Company, Inc

Oil del Golfo v. Gilbert ., 330 U.S. 501, 508, 91 L. Ed.Malversado de los secretos comerciales bajo la Ley Secreto Comercial de Florida, Estatutos de la Florida § 688.001 et seq.Fla. 1998) (citando .prácticas comerciales engañosas e injustas en virtud de la Ley de prácticas comerciales engañosas y desleales de la Florida, Estatutos de Florida § 501.204 et seq.doe v. Sun int'l Hotels, Ltd.


1619 palabras (4,0 paginas)
Ensayo de PCR en tiempo real

El QRT-PCR de dos pasos QRT-PCR se inicia con la transcripción inversa de ARN total o POLY (A) + ARN en ADNAM con una transcriptasa inversa (RT).| Las explicaciones comunes de PCR cuantitativa son el análisis de la expresión de genes, detección de patógenos / cuantificación y cuantificación de MicroRNA | Se pueden usar diferentes fluoróforos para los dos alelos, y la proporción de las señales de los fluoróforos se correlaciona con la cantidad relacionada de una forma en comparación con la otra.Se puede clonar el amplicón que se está estudiando, o se puede usar un oligonucleótido sintético (ARN o ADN).El proceso de PCR generalmente consiste en una serie de cambios de temperatura que se repiten 25 a 40 veces, estos ciclos normalmente consi...


4806 palabras (12,0 paginas)
Estructura y funciones de ADN y ARN

del par de base G = C es mayor en comparación con el par de bases A = T. Las hebras de ADN son antiparallas, ejecutando dos hebras en las direcciones opuestas.El azúcar de ribosa en ARN tiene un número máximo de oh-grupos en sus átomos de carbono en comparación con la molécula de ADN.Este ARN siempre está varado de forma única que constituye (5-10)% de la molécula de ARN total.Los ARN no genéticos habituales se transcriben en la plantilla de ADN que forman 3 tipos principales de ARN (ARNT, ARNm y RRNA).Por lo tanto, el ADN es más adecuado como un material hereditario que la molécula de ARN.


2092 palabras (5,2 paginas)
Ensayo en la señorita Havisham en grandes expectativas

Oxford: Clarendon, 1996."Cuerpos de capital: grandes expectativas y la economía climatica".SEQ = 1 # Page_Scan_tab_contents .Pequeño, Helen.29 de junio de 2015. .


477 palabras (1,2 paginas)
Ensayo de virus de ARN

Un ARN viral antisentido es complementario al ARN mensajero y, por lo tanto, debe convertirse en ARN de detección mediante un ARN polimerasa dependiente de ARN para poder ser traducido a proteínas.El ARN con polaridad positiva es idéntica a la de los RNA de mensajería viral, de modo que el ARN viral pueda traducirse inmediatamente por la célula huésped.Los virus de ARN generalmente tienen una alta tasa de mutación, en ausencia de ADN polimerasa capaz de manchar y corregir errores, y por lo tanto son incapaces de reparar el ARN del material genético dañado.Los virus de ARN también pueden clasificarse, dependiendo de la polaridad de su ARN, en polaridad negativa (antisentido), polaridad positiva (sentido) o virus doble polaridad (ambisense...


812 palabras (2,0 paginas)
Papel de iones metálicos en bioquímica

El ion hidratado también puede acomodar una amplia gama de interacciones estructurales a través de su orientación de las moléculas de agua en comparación con la coordinación directa de los iones metálicos en cada sitio.Tal enzima probablemente usaría un cofactor de iones metálico que no sea MG (II), por lo que la búsqueda de moléculas de ARN que usan naturalmente iones alternativas es de interés significativo.Dada la disponibilidad de iones metálicos, seguramente desempeñarán un papel importante en la biología de los ARN actuales y futuros.Las nucleasas de proteínas y las enzimas de ARN dependen de los iones metálicos divalentes para catalizar la hidrólisis rápida de los enlaces de diéster de fosfato de los ácidos nucleicos durante la re...


5897 palabras (14,7 paginas)
ADN y ARN en células sanguíneas

Entre los granulocitos, los neutrófilos tienen una concentración más alta que en comparación con los otros granulocitos (eosinófilos y basófilos) que componen un rango de 54% -62% de los glóbulos blancos.En comparación con los agranulocitos que tienen la mayor concentración entre otros agranulocitos (linfocitos con el rango de 25% -33% de los glóbulos blancos), se puede concluir que se observarían más granulocitos que los agranulocitos.Esto se debe al hecho de que RNase, una enzima, cataliza la degradación del ARN.La diapositiva que solo se tiñó con MGP contenía tanto ADN como ARN, que se puede concluir al hecho de que la celda se tiñó de color verde en el núcleo y en rojo rosa en el citoplasma.También se observó que RNase se observó ARN...


1635 palabras (4,1 paginas)
Trabajo adicional en el ensayo de bancarrota

Sin embargo, algunos optan por el Capítulo 7, ya que el procedimiento completo solo toma aproximadamente de 3 a 6 meses en contra de tener que lidiar con sus obligaciones de deuda por hasta cinco años cuando presenta en virtud del Capítulo 13. .Y la Ley de Informes de Crédito Justo (15 USC 1681 et seq.)La Ley de Prevención de Abuso y Protección del Consumidor de Bancarrota de 2005 .Debemos aprender a administrar nuestras deudas y vivir dentro de nuestros medios y siempre tenga en cuenta que los préstamos significa que está descontando su propio futuro.En la prueba de medios, sus ingresos, después de restar ciertos gastos permitidos, así como los pagos mensuales para sus deudas garantizadas, deben tener menos de $ 100 para que pueda solic...


800 palabras (2 paginas)
La evaluación de la sociedad en los viajes de Gulliver de Jonathan Swift

Nueva York: Prentice-Hall, 1976.Lock, F. P. La política de los viajes de Gulliver.La mente y el arte de Jonathan Swift.TUVERSON, ERNEST.Gloucester, Misa: Peter Smith, 1965.


3551 palabras (8,9 paginas)
Clasificación de virus ensayos

La información genética se almacena en forma de ARN.La información genética está codificada en forma de ARN.Ninguno de ellos afirma ser filogenética, ya que el origen común de los virus aún no se puede demostrar en comparación de sus secuencias de nucleótidos.El ARN está presente en las células como intermediario cuando los genes se traducen a proteínas.La sucursal validada es la de los virus de ARN de varátorización de la polaridad negativa, llamada negarnaviricota y se divide en dos sub-ramas, haploviricotina (incluido el virus del ébola y el virus de la rabia) y la poliploviricotina (incluido el virus de la fiebre de lazo) y el virus de la influenza A).


661 palabras (1,7 paginas)
Tecnología antisentida y sus aplicaciones

Cuando se une el ARN para el ARNm complementario, forma un ARN de doble cadena (ds ARN) complejo que es similar a duplicar ADN de cadena.La molécula de ARN madura se deja cuando se escinden los intrones.Este enlace forma la ARN dímero en citoplasma y detiene la síntesis de proteínas.En el complejo ribosómico, los oligonucleótidos de ARN cortos no son estables debido a la presencia de enzimas de helicasa, mientras que los oligonucleótidos de ARN más largos activa la vía RNAI.Esta modificación fue llamado como phosphhorothioate que logra la meta de resistencia a la nucleasa medido por un aumento de la vida media para un oligonucleótido fosforotioado hasta horas diez en el suero humano en comparación con la de una hora de un oligonucleótido...


2684 palabras (6,7 paginas)
Alineación de secuencia y programación dinámica

En la etapa final, para alinear grupos de secuencias, se requiere rastrear información de la alineación completa de la pareja.Alineación local: F (I, j) = Puntuación de la mejor alineación de un sufijo de S [1 ...Para resolver problemas de alineación de secuencias múltiples, el algoritmo más común utilizado es el método progresivo.Los dos algoritmos, Smith-Waterman para la alineación local y la necesidad, Wunsch-Wunsch para la alineación global, se basan en la programación dinámica.Al comparar los diferentes métodos para implementar la alineación de la secuencia de pares y la alineación de múltiples secuencias, podemos concluir que usando algoritmos paralelos que implementan el modelo de tubería o el modelo anti-diagonal son Algoritmo ef...


3119 palabras (7,8 paginas)
Dicotomía del bien y del mal en Beowulf

El poema heroico, es una combinación de puntos de vista de la sociedad y ideales y conceptos religiosos del período anglosajón, aunque algunos del poema Hoy puede parecer diferentes en comparación con el texto original antes de la traducción.Mientras que el bien en comparación con el mal es un tema común que se ve en múltiples folklores antes del cristianismo, la cristianización de la sociedad anglosajona ha influido en el transcriptor para relacionar la historia a una audiencia cristiana de un internador.La Antología Norton de la literatura inglesa (9º Ed., Vol.1).El colorante cristiano en el beowulf.NUEVA YORK, NY: W. W. NORTON & AMP; Empresa, Inc. .


1583 palabras (4,0 paginas)

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