Comparaison D'Alignement Arn Seq Essais


A trouvé 26297 essais.

Rapport sur la transcriptomique RNA-seq

Afin de caractériser les petits ARN non codants, de petits microarrays ARN-SEQ ou miARN sont utilisés.Plus spécifiquement, l'ARNm est traduit en protéines, tandis que les ARN non codants peuvent être classés soit en tant qu'ARNt, ARNr, snARN, snoRNA et gRNA) ou en tant que régulateur.samtools index Accepté_hits.sorted.bam .Les ARN sont soit codants, soit non codants, ce qui signifie que certains ARN codent pour des protéines, tandis que d'autres types d'ARN ne le sont pas.Les ARN domestiques agissent comme des éléments catalytiques et structurels.


2674 mots (6,7 pages)
Comprendre une séquence de protéines inconnue

La séquence de requête a été identifiée comme protéine prédite [Physcomitrella patens] & gt; gi | 162695322 | gb | EDQ81666.1 | ID seq: gi | 168001481 | ref | XP_001753443.1.Le nom d'identification complet donné dans la page de résultats est la protéine prédite [Physcomitrella patens] & gt; gi | 162695322 | gb | EDQ81666.1 | ID seq: gi | 168001481 | ref | XP_001753443.1.Il se peut également que la deuxième protéine dans la correspondance de similarité, Seq ID: gi | 168035394 | ref | XP_001770195.1 soit éloignée de la protéine de requête.La figure, comme montré ci-dessous, illustre uniquement le faisceau à 3 hélices de liaison ADN / ARN avec un pourcentage d'identité de 25% où 31 résidus ont été modélisés avec un niveau de confiance de 9,...


3041 mots (7,6 pages)
Nouveaux effets de line-up pour présentation séquentielle uniquement (SPO)

En comparaison, les conditions d'absence de cible risquent de produire des foils avec la ressemblance la plus proche à choisir, produisant en fait plus de fausses alarmes.Une ANOVA unidirectionnelle a montré une différence significative dans les fausses alarmes, (2, 684) = 9.28, & lt; .001, Une analyse post-hoc avec la correction de Bonferroni pour les comparaisons multiples a montré une différence significative dans le taux de fausses alarmes entre la condition SIM et SPO (= 0,69, & lt; 0,01), mais pas entre la condition SIM et la condition SEQ (0,01 , 1,00) ainsi que SEQ et la condition SPO (= 0,06, = 0,004).(1), 277-295. .L '«effet de supériorité» découle de la précision globale améliorée car SEQ réduit les fausses identifications (fa...


3064 mots (7,7 pages)
Alignement de séquences Rédaction

..L'alignement multiple consiste à aligner collectivement un ensemble de séquences homologues, comme des séquences de protéines assurant des fonctions similaires dans différentes espèces vivantes...Pour réaliser un alignement multiple, il faut généraliser la notion de fonction de score définie plus haut pour deux séquences.L'alignement multiple permet entre autres d'identifier les régions très conservées qui sont en général associées à des fonctions biologiques importantes, conservées dans l'Évolution.La généralisation de la fonction de score habituellement utilisée consiste donc à utiliser ce qu'on appelle le score de la somme des paires au sein d'une colonne de l'alignement : .. S c o r e ( c o l o n n e ) = ∑ i < j M ( X i...


1571 mots (3,9 pages)
Analyse de GATA3 ChIP-seq dans les quatre cellules

Nous suggérons que ER1, FOXA1, AKR1C1 et LGALS pourraient jouer un rôle important dans l'action régulatrice de GATA3 sur les cellules tumorales.En outre, un enrichissement significatif du motif «GAT» a indiqué que «GAT» pourrait jouer un rôle important dans l'identification et la combinaison de GATA3 et de l'ADN.En conclusion, nous avons comparé et analysé les données GATA3 ChIP-Seq dans les quatre cellules tumorales (A549, T47-D, MCF7 et SK-N-SH).Cependant, en raison de la grande quantité de gènes cibles spécifiques GATA3 dans les quatre cellules tumorales, nous n'avons pas pu trouver le mécanisme de régulation spécifique dans les quatre cellules tumorales.Les raisons pourraient être que GATA3 peut se lier à différentes régions dans les...


3388 mots (8,5 pages)
Transcription Niveau d'expression du Kelampayan blanc

La comparaison de l'expression génique entre les échantillons peut être déterminée directement une fois que RPKM est utilisé.L'annotation fonctionnelle des données RNA-seq du kelampayan blanc devrait être définie en termes d'ontologie génétique via le programme Blast2GO.Des données d'analyse à haut débit seront obtenues afin d'améliorer la qualité des données génétiques et l'identité du transcriptome de l'arbre kelampayan.Les résultats de l'analyse statistique sur le niveau d'expression des transcriptions seront visualisés dans des parcelles de volcan avec CLC Genomics Workbench 7.5 (Qiagen, Danemark).Sur l'analyse des proportions, en particulier le test Z (Kal, 1999), quatre colonnes («Différence de proportions», «Fold Change», «Test st...


2212 mots (5,5 pages)
Techniques de comparaison des génomes Rédaction

Les techniques d'accélération des comparaisons de génomes sont l’un des axes les plus importants en bio-informatique qui a pour but de remédier à un problème scientifique posé par la biologie « faire ressortir les régions ou séquences homologues ou différentes » ; on parle donc des méthodes de comparaison de deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes par rapport aux autres.Si oui, on peut déduire par comparaison quelques-unes des données expérimentales recueillies de cette façon à la nouvelle séquence.Mais il existe aussi des « gènes morcelés » ou codons des ARN fonctionnels, ceux-ci doivent être prédits par des algorithmes différents...En septembre 2007, une équipe menée par le biologiste ...


3395 mots (8,5 pages)
Gènes et mécanismes du cancer colorectal (CRC)

Dans notre étude, AQP8 a été surexprimé dans les échantillons de CRC, ce qui suggère qu'il peut inhiber le développement du CRC.Le résultat des lectures & lt; 2 incompatibilité de base et & lt; 2 longueurs d'intervalle étaient nécessaires lors de la comparaison.Ces résultats ont montré que ABCG2, ATP1A2 et AQP8 peuvent être des gènes cibles thérapeutiques potentiels pour le CRC.Les molécules d'eau jouent un rôle clé dans la modulation du microenvironnement tumoral, la tumorigenèse et le métabolisme tumoral [37].En conclusion, notre étude montre que l'interaction cytokine-récepteur cytokine, la voie de signalisation du TNF et les fonctions de sécrétion biliaire peuvent être étroitement associées au développement du CRC.


2709 mots (6,8 pages)
Approches de prédiction CRM et de validation CRM

Un autre site Web de base de données couramment utilisé est la base de données Genome Browser de l'Université de Californie à Santa Cruz (UCSC), qui fournit tous les aspects des informations pour la prédiction CRM, y compris expérimental (clusters d'hypersensibilité à la DNase, marques épigénétiques des protéines histones et liaison des facteurs de transcription de ChIP seq) ainsi qu'une étude informatique (niveau de conservation chez les vertébrés à partir de l'alignement des séquences d'ADN) [181].Les fonctions globales des miARN associés au HCC sont impliquées dans STAT3, en modulant les fonctions Bcl-2 et Mcl-1, et les voies inflammatoires de NF-κB, conduisant à l'hépatocacinogenèse [245].En utilisant la base de données génomique de ...


3393 mots (8,5 pages)
Catégories de multimètres pour l'électronique

Quelques erreurs pourraient apporter ces distinctions de la part des expérimentateurs et d'autres facteurs indésirables .Figure SEQ Figure \ * ARABIC 3 .Les valeurs mesurées obtenues en utilisant le multi-testeur présentent une certaine disparité avec les valeurs codées d'ombrage.C'est très déroutant sur la méthode la plus efficace pour fabriquer les résistances dans leur forme parallèle et mesurer également les tensions et les courants sur le circuit.Les résistances associées en parallèle ont une puissance similaire, cependant, varient dans leurs estimations de flux.


3202 mots (8,0 pages)
Prioriser les cibles de médicaments pour les antipaludiques

Néanmoins, son processus biologique et sa fonction moléculaire sont vraiment importants que les autres requêtes cibles pour synthétiser le médicament afin d'atteindre le but d'éliminer le parasite.Ian AL, Mark W, Kellen LO, Simon AC, Katelynn SB, Asako T, Michael TF, Manuel L: Analyse Métabolique QTL Liens Résistance à la chloroquine dans Plasmodium falciparum au catabolisme de l'hémoglobine altérée, 2014; (1).Zuegge J, Ralph S, Schmuker M, McFadden GI, Schneider G: Décryptage des signaux de ciblage des apicoplastes - extraction de caractéristiques à partir de précurseurs nucléaires codés des protéines apicoplastes de Plasmodium falciparum.Hall N, Pain A, Berriman M, Churcher C, Harris B, Harris D, Mungall K, Bowman S: Séquence des chrom...


2131 mots (5,3 pages)
Classification des virus Rédaction

..L'officialisation en octobre 2018 du rang taxonomique d'embranchement pour les virus à ARN simple brin à polarité négative (Negarnaviricota) est fondée sur la phylogénie d'un marqueur universel des virus à ARN, l'ARN polymérase ARN-dépendante.La classification adoptée est la suivante, jusqu'au rang des familles (la classification complète inclut les genres et les espèces) : ..L'information génétique est codée sous forme d'ARN.Aucune des deux ne prétend être phylogénétique, car l'origine commune des virus ne peut pas encore être mise en évidence par la comparaison de leurs séquences nucléotidiques.La réplication se base sur l'ARNm.Une enzyme associée au virus, la transcriptase inverse, crée de l'ADN à partir de l'ARN pour assurer la rép...


637 mots (1,6 pages)
Essai d'adénosine triphosphate et de respiration aérobie

Tableau de comparaison Intégrer ce tableau Respiration aérobie Respiration anaérobie Définition La respiration aérobie utilise de l'oxygène.Méiose vs mitose 4.Conditions d'utilisation | Politique de confidentialité share x Up next Oxygen vs. Ozone.title = Cellular_respiration & amp; oldid = 320134686 Comparaisons connexes Oxygène vs ozone Oxygène vs ozone Mitose vs méiose Mitose vs méiose ADN vs ARN ADN vs ARN Photosynthèse vs respiration .Photosynthèse vs respiration Moisissure vs moisissure de levure vs levure Commentaires: Respiration aérobie vs Anaerobic Respiration Facebook Anonymous (4) Restez informé Recevez des alertes par e-mail lorsque de nouvelles comparaisons sont publiées dans ces catégories: Science L Biology Comparaisons c...


1108 mots (2,8 pages)
Alignement de séquence et programmation dynamique

l'alignement met en œuvre la méthode progressive.Les algorithmes qui implémentent une méthode progressive telle que ClustalW sont des algorithmes efficaces pour résoudre des problèmes d'alignement de séquences multiples.La complexité temporelle de cette méthode est O (N + L) et la complexité spatiale est O (N + L).En comparant les différentes méthodes pour implémenter l'alignement de séquences par paires et l'alignement de séquences multiples, nous pouvons conclure que l'utilisation d'algorithmes parallèles qui implémentent un modèle de pipeline ou un modèle anti-diagonal sont algorithme efficace pour effectuer des alignements de séquences par paires.Cet algorithme est devenu le plus populaire pour les séquences multiples.


2939 mots (7,3 pages)
Essai sur Miss Havisham dans de grandes attentes

Oxford: Clarendon, 1996."Miss Havisham's Objectification of Estella.""Bodies of Capital: Great Expectations and the Climacteric Economy."18 juin 2015. .Victorian Studies 37 (1993): 73 -97.


450 mots (1,1 pages)
Comparing The Road Not Taken, par Robert Frost et The Worn Path, par Eudora Welty

Saunders, J. R. (1992).The Southern Literary Journal, 25 (1), 62-73.Types of Literary Critisim Extrait de .Iannone, C. (2005, 1er juin).Pollack, H. (1997) Photographic Convention and Story Composition South Central Review .


477 mots (1,2 pages)
Tarification Oligopole: vieilles idées et nouveaux outils

Figure SEQ Figure * ARABIC 2: le prix de l'essence augmente lorsque la taxe est imposée .Tarification Oligopole: vieilles idées et nouveaux outils.Figure SEQ Figure * ARABE 4: le graphique montre une diminution de la demande de voitures à haut rendement énergétique lorsque le prix de l'essence augmente .Figure SEQ Figure * ARABE 1: quand les gens s'attendent à des troubles civils, la demande est élevée mais les prix augmentent.Document source .


1748 mots (4,4 pages)
Essai de questions et réponses sur l'économie

Principes de microéconomies.Figure SEQ Figure * ARABE 5: L'offre excédentaire de poulet sur le marché entraîne une faible demande et tombe finalement dans le prix.Cambridge, Mass.Figure SEQ Figure * ARABE 1: lorsque les gens s'attendent à des troubles civils, la demande est élevée mais les prix augmentent.Mason, OH: Apprentissage du Cengage du Sud-Ouest .


1800 mots (4,5 pages)
Gènes des transporteurs de calcium

Une telle étude nous permettra de comprendre et de formuler des stratégies efficaces pour augmenter les niveaux de calcium dans les grains.de calcium dans le grain en développement.Pour les organismes non modèles avec des informations génomiques limitées, le séquençage du transcriptome fournit un outil économique en séquençant uniquement les ARN fonctionnels et codant pour les protéines, fournissant ainsi des informations directes sur les gènes.En outre, les gènes identifiés comme régulés à la hausse dans le génotype à haute teneur en calcium des grains peuvent être utilisés comme gène candidat pour améliorer la teneur en calcium de génotypes qui sont agronomiquement plus performants mais contiennent une faible teneur en calcium.Par cons...


2756 mots (6,9 pages)
Essai de Sippican Corporation

Cela pourrait causer du malheur à ceux qui se considèrent plus productifs que les autres.Avantages: meilleure ambiance de travail, satisfaction, motivation accrue et situation gagnant-gagnant pour les cadres et les travailleurs.Développer un programme d'incitation à la main-d'œuvre pour une productivité plus élevée - Les dirigeants doivent organiser l'enseignement des bases de TDABC à la main-d'œuvre afin de leur permettre de comprendre comment apporter leur contribution à leur entreprise.Défis: Il est impossible d'offrir l'incitation parfaitement équitable à chaque travailleur, fondamentalement, les économies totales de main-d'œuvre seraient divisées par le nombre de travailleurs et un certain pourcentage serait partagé également.Cepend...


2243 mots (5,6 pages)
Contrôle de la mise en pause de Pol II

En 2008, notre laboratoire a identifié Zelda (Zld; Zinc-finger early Drosophila activator; également connu sous le nom de Vfl) comme étant l'activateur clé du génome zygotique précoce de la drosophile (Liang et al., 2008).Une question de longue date dans le domaine de l'embryogenèse a été de savoir quels facteurs déclenchent la ZGA.Pour résumer, bien que la mise en pause de Pol II soit apparue comme une étape importante dans la régulation transcriptionnelle, on ne sait pas comment Pol II est initialement recruté pour les promoteurs, et quels TF déclenchent la libération de Pol II via P-TEFb.L'ARNm de zld est chargé par la mère des cellules nourricières de l'ovaire et est uniformément réparti dans l'embryon à l'exclusion des PGC jusqu'à l...


2770 mots (6,9 pages)
L'évaluation de la société dans les voyages de Jonathan Swift à Gulliver

Lock, F. P. The Politics of Gulliver's Travels.Oxford, Grande-Bretagne: Oxford University Press, 1980.Tuveson, Ernest.Swift: Une collection d'essais critiques.15 juin 2015. .


3463 mots (8,7 pages)
Virus à ARN Rédaction

..Bien que l'ARN mute en général rapidement, un travail récent a révélé que le virus du SRAS et des virus à ARN apparentés contiennent un génome qui mute très lentement par rapport à ce qui serait attendu si les mutations n'étaient pas contrôlées du tout.Un ARN viral antisens est complémentaire de l'ARN messager et doit donc être converti en ARN sens par une ARN polymérase ARN-dépendante pour pouvoir être traduit en protéines.Ces dernières années, des progrès remarquables ont été accomplis dans la détermination, au niveau atomique et subnanométrique, de la structure d'un certain nombre de protéines virales déterminantes constitutives de la capside du virion de plusieurs virus à ARN bicaténaire, en soulignant des parallèles importants dan...


780 mots (2,0 pages)
Origine de la vie Rédaction

..Dans ce scénario, l'apparition de trois lignées uniquement s'explique par le fait que les cellules à ADN ont peu à peu supplanté les cellules à ARN, empêchant ainsi l'apparition de nouvelles lignées par passage ARN→ADN...La comparaison de l'ARN des ribosomes montre l'émergence de trois formes de cellules : les bactéries, les archées, et les eucaryotes,...L'hypothèse de Patrick Forterre est que les trois lignées du vivant trouvent leurs sources dans le remplacement du génome à ARN par le génome à ADN de trois virus différents...Dans la biochimie actuelle, l'acide ribonucléique (ARN) joue un double rôle d'intermédiaire entre l'ADN support d'information et les polypeptides catalyseurs : l'ARN polymérase guide la polymérisation d'un brin A...


13246 mots (33,1 pages)
Petit ARN interférent Rédaction

Ce complexe activé va reconnaître son transcrit cible, un ARN messager, par complémentarité des bases nucléiques..Les petits ARN interférents (pARNi, ou siRNA pour small interfering RNA) sont de petits ARN pouvant se lier spécifiquement à une séquence d'ARN messagers et ainsi empêcher l'expression de gènes en clivant cet ARN.La transfection de petits ARN interférents dans les cellules a donc pour conséquence la destruction spécifique des ARN messagers ciblés, empêchant toute nouvelle traduction de la protéine codée par ces ARN messagers.Ce dispositif ne permet cependant pas de cibler un organe particulier...Plusieurs essais sont en cours chez l'être humain, avec pour cible l'apolipoprotéine(a), le PCSK9 ou la transthyrétine (avec le pati...


328 mots (0,8 pages)
Acide ribonucléique Rédaction

..Les ARN de transfert, ou ARNt, sont de courts ARN, longs d'environ 70 à 100 ribonucléotides, impliqués dans l'adressage des acides aminés vers les ribosomes lors de la traduction.Ces ARN antisens peuvent être issus du même locus génétique que leur ARN cible, par transcription du brin complémentaire, on parle alors d'ARN cis-régulateurs...L'épissage est une modification post-transcriptionnelle qui consiste en l'élimination des introns et la suture des exons dans les ARN messagers et dans certains ARN structurés comme les ARNt...L'ARN est utilisé aujourd'hui dans un certain nombre d'applications en biologie moléculaire, en particulier grâce au processus d'interférence par ARN, qui consiste en l'introduction dans des cellules eucaryotes d...


5107 mots (12,8 pages)
Outils de bioinformatique pour l'analyse de séquence

uniprot | Q90582 | Q90582_CHICK LVIKQEPREEEEVKAAALAALYPHPQQHP 3 résidus conservés détectés, il y avait une grande quantité de mutations et de changements évolutifs entre les espèces au fil du temps.Comme il y a moins de résidus conversés sur l'alignement de séquences multiples, cela suggère que ma séquence n'est pas susceptible d'être fonctionnellement liée aux espèces détectées par BLAST, mais cela ne signifie pas qu'elles ne sont pas liées.L'outil très rapide et sensible sélectionne les similitudes dans l'ordre dans tous les cadres de lecture de la requête nucléotidique et produit une liste de comparaison à partir de protéines connues de comparaison élevée avec des protéines avec de faibles comparaisons.uniprot | Q76E40 | Q76E40_XENLA ...


2183 mots (5,5 pages)
Mitochondries: génome, héritage et caractéristiques

À l'appui d'un tel lien entre la longévité et l'ADN mitochondrial, certaines études ont trouvé des corrélations entre les propriétés biochimiques de l'ADN mitochondrial et la longévité des espèces.Ces 37 gènes codent pour 2 ARN ribosomaux, 22 ARN de transfert et 13 polypeptides.Comme il n'y a pas de changement dans l'ADN mitochondrial du parent à la progéniture et que le taux de mutation est plus élevé, c'est un outil puissant pour suivre l'ascendance à travers les femelles (matrilignage) et a été utilisé dans ce rôle de suivre l'ascendance de nombreuses espèces sur des centaines de générations.C'était le premier essai aux États-Unis à admettre l'ADN canin.Les données des comparaisons sont utilisées pour construire un réseau de relations...


2337 mots (5,8 pages)
En savoir plus sur l'ARN

ARN signifie acide ribonucléique.Sans ARN, les protéines ne pourraient jamais être produites.Cela utilise des enzymes comme les ARN polymérases.La RNase P est composée à la fois d'ARN et de protéines; cependant, le fragment ARN seul est le catalyseur.Les ARN comme enzymes .


653 mots (1,6 pages)
Intron Rédaction

..Chez les eucaryotes, on trouve des introns particuliers dans les ARN de transfert, localisés dans la boucle de l'anticodon, qui sont épissés par l'action de protéines nucléaires spécifiques.On trouve aussi des introns dans des gènes codant des ARN non codants comme les ARN ribosomiques ou les ARN de transfert.Chaque snRNP est constitué d'un ARN spécifique (ARNsn ou petit ARN nucléaire) et de plusieurs protéines associés en complexes..Un intron est une portion d'un gène qui est transcrite en ARN, au sein d'un ARN précurseur, et qui est ensuite éliminée par un processus d'excision programmé et qu'on ne retrouve donc pas dans l'ARN mature...Lorsque tous les introns sont excisés, le pré-ARNm devient un ARNm (ARN messager mature) prêt à la ...


1287 mots (3,2 pages)

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