Analyse De Rna Seq Kegg Essais


A trouvé 340844 essais.

Gènes et mécanismes du cancer colorectal (CRC)

: cancer colorectal; gènes différentiellement exprimés; analyse bioinformatique .Cependant, d'autres études sont encore nécessaires pour confirmer nos résultats.Des gènes tels que PTGS2, CXCL3, IL8, ABCG2, ATP1A2 et AQP8 peuvent être des gènes cibles thérapeutiques potentiels pour le CRC.Une analyse de regroupement hiérarchique des DEG dans le cancer colorectal a été réalisée.Des analyses d'enrichissement de l'ontologie des gènes (GO) et de l'Encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes (KEGG) des DEG ont été effectuées.


2709 mots (6,8 pages)
Prioriser les cibles de médicaments pour les antipaludiques

Comme le montre la figure 20, neuf étapes différentes au cours du développement de P. falciparum 3D7 ont été testées par analyse de micropuces d'oligonucléotides .Ian AL, Mark W, Kellen LO, Simon AC, Katelynn SB, Asako T, Michael TF, Manuel L: Analyse Métabolique QTL Liens Résistance à la chloroquine dans Plasmodium falciparum au catabolisme de l'hémoglobine altérée, 2014; (1).Comme le montre la figure 7, neuf étapes différentes au cours du développement de P. falciparum 3D7 ont été testées par analyse de micropuces d'oligonucléotides .2002, (6906): 527-31. .Comme le montre la figure 10, neuf étapes différentes au cours du développement de P. falciparum 3D7 ont été testées par analyse de micropuces d'oligonucléotides .


2131 mots (5,3 pages)
Transcription Niveau d'expression du Kelampayan blanc

Sur l'analyse des proportions, en particulier le test Z (Kal, 1999), quatre colonnes («Différence de proportions», «Fold Change», «Test statistics» et «P-value») seront créées et ajoutées à le tableau d'expérimentation pour chaque groupe analysé paires: Xylème et laisse des groupes de tissus.Les résultats de l'analyse statistique sur le niveau d'expression des transcriptions seront visualisés dans des parcelles de volcan avec CLC Genomics Workbench 7.5 (Qiagen, Danemark).L'une des trois analyses statistiques, «Sur les proportions», sera appliquée pour mesurer le niveau d'expression des transcriptions.Des données d'analyse à haut débit seront obtenues afin d'améliorer la qualité des données génétiques et l'identité du transcriptome de l'a...


2212 mots (5,5 pages)
Analyse de GATA3 ChIP-seq dans les quatre cellules

Le gène cible GATA3 dans les quatre cellules tumorales a en outre été soumis à une analyse d'enrichissement des voies, à une analyse d'enrichissement d'ontologie génique et à l'identification de motifs.En outre, la régulation spécifique de GATA3 dans les quatre cellules tumorales doit être démontrée en combinaison avec des données expérimentales.Cependant, en raison de la grande quantité de gènes cibles spécifiques GATA3 dans les quatre cellules tumorales, nous n'avons pas pu trouver le mécanisme de régulation spécifique dans les quatre cellules tumorales.Pour savoir si les gènes cibles 4839 GATA3 partagent une voie spécifique, nous avons effectué une analyse d'enrichissement de voie à l'aide de g: Profiler.6 des 15 voies KEGG étaient li...


3388 mots (8,5 pages)
Rapport sur la transcriptomique RNA-seq

#PBS -d / export / home / biostuds / 2161696g / tophat / tb1 .bam, / export / home / biostuds / 2161696g / tophat / tb2 / allowed_hits.bam, ./export/home/biostuds/2161696g/tophat/wf3/accepted_hits.bam .-M [email protected] .samtools sort Accepté_hits.bam Accepté_hits.sorted .


2674 mots (6,7 pages)
DEG significatifs dans le cancer de la vessie

Dans la présente étude, des gènes significatifs exprimés différentiellement (DEG) dans les cellules tumorales de la vessie ont été identifiés et deux profils de microréseau, GSE24152 et GSE42089, ont été utilisés pour le criblage de gènes significatifs exprimés différentiellement (DEG), suivis Analyse de l'ontologie des gènes (GO) et de l'encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes (KEGG).Le diagramme de Venn a été généré en utilisant le package VennDiagram [12] pour cribler les DEG communs pour une analyse plus approfondie.Le réseau sur tous les DEG a été construit (Figure 3) et ainsi une analyse de clustering a été effectuée sur le réseau.Les principaux termes GO et les voies KEGG de 619 DEG communs ont été listés dans le tableau 1....


2518 mots (6,3 pages)
Gènes des transporteurs de calcium

La présente enquête a été menée pour identifier les gènes candidats potentiels qui pourraient être responsables de l'accumulation et du stockage du calcium dans le grain en développement de l'éleusine avec les objectifs suivants: .En outre, les gènes identifiés comme régulés à la hausse dans le génotype à haute teneur en calcium des grains peuvent être utilisés comme gène candidat pour améliorer la teneur en calcium de génotypes qui sont agronomiquement plus performants mais contiennent une faible teneur en calcium.Une telle approche combinée d'analyses et de suivi expérimental conduira à une compréhension globale des événements cruciaux du développement des semences dans les céréales.Par conséquent, dans les études parallèles sur le riz...


2756 mots (6,9 pages)
Rôle de la doxycycline dans le cancer de la prostate avec microarray

L'encyclopédie des gènes et des génomes de Kyoto (KEGG) est une collection largement utilisée de bases de données en ligne qui traite des génomes, des voies enzymatiques et des produits chimiques biologiques.cancer de la prostate; doxycycline; analyse des voies; gènes différentiellement exprimés.Ensuite, les fonctions et les voies des DEG communs criblés ont été analysées en utilisant le DAVID de la base de données des voies KEGG avec la valeur p & lt; 0,05. .Par conséquent, plus d'analyses et d'expériences devraient être effectuées pour des recherches ultérieures.Les principales voies KEGG des DEG identifiées dans les échantillons de cas de doxycycline au jour 2 ont été répertoriées dans le tableau 2.


3732 mots (9,3 pages)
Gènes candidats liés à l'athérosclérose

Le gène le plus significatif était le complexe majeur d'histocompatibilité, classe II, DQ beta 1 (HLA-DQB1) dans les 14 voies biologiques basées sur l'analyse d'enrichissement des voies de KEGG.Suite à l'analyse d'enrichissement des voies de KEGG, 14 voies biologiques (présentées dans le tableau 3) ont été choisies selon FDR & lt; 0,05.Après une analyse par grappes de DEG, 28 gènes ont été sélectionnés parmi les 69 ensembles de gènes de regroupement.Un total de 29 échantillons, constitués de 13 échantillons d'athérosclérose précoce et 16 échantillons d'athérosclérose avancée, étaient disponibles dans la présente analyse.l'athérosclérose; analyse bioinformatique; gènes différentiellement exprimés .


2251 mots (5,6 pages)
Comprendre une séquence de protéines inconnue

Le nom d'identification complet donné dans la page de résultats est la protéine prédite [Physcomitrella patens] & gt; gi | 162695322 | gb | EDQ81666.1 | ID seq: gi | 168001481 | ref | XP_001753443.1.La séquence de requête a été identifiée comme protéine prédite [Physcomitrella patens] & gt; gi | 162695322 | gb | EDQ81666.1 | ID seq: gi | 168001481 | ref | XP_001753443.1.Figure 2: (A) PSI-BLAST montre l'indice de similarité avec la séquence de requête (B) Les résultats ClustalW2 montrent l'alignement entre les protéines prédites (Seq ID: gi | 168001481 | ref | XP_001753443 .1) et protéine prédite (Seq ID: gi | 168035394 | ref | XP_001770195.1).Il se peut également que la deuxième protéine dans la correspondance de similarité, Seq ID: gi |...


3041 mots (7,6 pages)
MiARN et gènes dans CIN

Nous avons utilisé le DAVID pour identifier les Voies KEGG liées aux DEG.Ils peuvent être utilisés pour détecter le cancer du col de l'utérus à un stade précoce.Aucun terme significatif de la voie KEGG n'a été trouvé dans cette étude.Cependant, d'autres expériences sont encore nécessaires pour confirmer notre résultat.Au total, 30 échantillons étaient disponibles pour une analyse plus approfondie, dont 8 échantillons CIN III (GSM1256881 - GSM1256888) et 7 échantillons de col de l'utérus normal (GSM1256898 - GSM1256904) de la plate-forme de GPL8179, 8 échantillons CIN III (GSM1256905 - GSM1256912) et 7 échantillons normaux de col de l'utérus (GSM1256922 - GSM1256928) de la plate-forme de GPL10558.


2464 mots (6,2 pages)
Caractérisation moléculaire et biochimique de l'α-glucosidase

Autrement dit, moins de 0% d'écarts d'alignement, de données manquantes et de bases ambiguës étaient autorisés à n'importe quelle position.Les auteurs conseillent à l'utilisateur de vérifier attentivement la légende avant son utilisation à quelque fin que ce soit et de signaler immédiatement toute erreur ou problème aux auteurs (www.megasoftware.net).Il y avait un total de 475 positions dans l'ensemble de données final.Clause de non-responsabilité: bien que le plus grand soin ait été pris pour assurer l'exactitude de la légende, le texte de la légende est fourni «tel quel» sans aucune garantie d'aucune sorte.2014), à l'exception du C23 qui a été obtenu à partir de KEGG Genes L'alignement des séquences et l'arbre phylogénétique ont été ré...


2175 mots (5,4 pages)
DEG dans le cancer de l'ovaire avec Silencing IRF1

Nous avons effectué un enrichissement GO et KEGG avec p-value & lt; 0,05 pour l'analyse fonctionnelle et de la voie des DEG, respectivement.Après l'identification des gènes différentiellement exprimés (DEG), une analyse des voies a été réalisée sur les DEG et un réseau d'interaction protéine-protéine (PPI) a été construit.cancer de l'ovaire, facteur de régulation de l'interféron 1, gènes différentiellement exprimés, analyse des voies, interaction protéine-protéine .Des gènes exprimés de manière significativement différentielle ont été identifiés et une analyse bioinformatique a été réalisée pour des recherches ultérieures.L'enrichissement GO et KEGG a été réalisé pour l'identification des voies significatives liées aux DEG dans le sous-r...


3442 mots (8,6 pages)
Mécanismes moléculaires de la septicémie

Pour approfondir les recherches sur l'association de ces nœuds concentrateurs avec la septicémie et vérifier le rôle des interactions entre les gènes dans la pathogenèse de la septicémie, d'autres études sont nécessaires à l'avenir.L'ensemble de données disponible dans cette analyse contenait 70 échantillons dont 34 patients polytraumatisés avec septicémie et 36 patients polytraumatisés sans septicémie.Pour le module 1, aucune voie n'a été enrichie dans l'analyse de voie KEGG.Une analyse phylogénétique plus poussée a indiqué la haute conservation de ces gènes concentrateurs.Les résultats détaillés de l'analyse de voie KEGG pour chaque module sont fournis dans le tableau 5.


3260 mots (8,2 pages)
Génie génétique: caractéristiques nutritionnelles du grain du riz

Par conséquent, l'amélioration de la valeur nutritionnelle du riz est essentielle pour réduire la santé mondiale, en particulier les enfants et les femmes souffrant de carences en micronutriments.(2009) ont transféré le gène du cultivar de riz Tsukinohikari et, par analyse de l'expression, des traits cibles ont-ils observé une amélioration significative de la concentration de fer et de zinc 2 à 3 fois plus élevée dans les grains de riz polis.(2011) ont effectué une analyse transcriptionnelle approfondie du rendement de la mouture et des gènes des caractères de qualité alimentaire dans le riz via MPSS et SBS.La disponibilité croissante de marqueurs génétiques plus précis, des outils de sélection avancés pourraient être utilisés, pour séle...


2149 mots (5,4 pages)
Nouveaux effets de line-up pour présentation séquentielle uniquement (SPO)

L'option de réponse incertaine dans la pratique de l'alignement séquentiel.Une ANOVA unidirectionnelle a montré une différence significative dans les fausses alarmes, (2, 684) = 9.28, & lt; .001, Une analyse post-hoc avec la correction de Bonferroni pour les comparaisons multiples a montré une différence significative dans le taux de fausses alarmes entre la condition SIM et SPO (= 0,69, & lt; 0,01), mais pas entre la condition SIM et la condition SEQ (0,01 , 1,00) ainsi que SEQ et la condition SPO (= 0,06, = 0,004).(1), 277-295. .L '«effet de supériorité» découle de la précision globale améliorée car SEQ réduit les fausses identifications (fausses alarmes) lorsque la cible est absente (conditions de cible absente), plus qu'il ne réduit ...


3064 mots (7,7 pages)
Réponses aux UV et IR dans les PBL

Au total, 4 voies ont été obtenues dans l'analyse d'enrichissement KEGG (tableau 2).[MF16] Pour l'identification des gènes caractéristiques avec la base de données de microarray disponible au public (GSE1977), nous avons utilisé ANOVA analyse aléatoire des forêts.En conclusion, nos données fournissent une analyse bioinformatique complète des gènes caractéristiques qui peuvent être impliqués dans les réponses induites par UV et IR dans les PBL.L'analyse d'enrichissement GO et l'analyse d'enrichissement de la voie KEGG ont été menées pour les gènes caractéristiques avec DAVID.Ensuite, les valeurs moyennes entre les groupes ont été comparées selon une analyse par mesures répétées de la variance (ANOVA) en utilisant le package genefilter [20...


2648 mots (6,6 pages)
Essai de Sippican Corporation

Exposition SEQ Pièce \ * ARABE 2 - Rentabilité des produits par approche de contribution et par marges brutes 552450571500 .En contrepartie, un certain pourcentage (par exemple 30%) pour chaque dollar économisé devrait être offert en augmentation de salaire en fin de mois.Cela pourrait causer du malheur à ceux qui se considèrent plus productifs que les autres.Avantages: meilleure ambiance de travail, satisfaction, motivation accrue et situation gagnant-gagnant pour les cadres et les travailleurs.Défis: Il est impossible d'offrir l'incitation parfaitement équitable à chaque travailleur, fondamentalement, les économies totales de main-d'œuvre seraient divisées par le nombre de travailleurs et un certain pourcentage serait partagé également...


2243 mots (5,6 pages)
Essai sur la contribution de Thomas R. Cech au domaine de la chimie

Nandakumar, J., Bell, C.F., Weidenfeld, I., Zaug, A.J., Leinwand, L.A., Cech, T.R.Le patch TEL de la protéine télomère TPP1 intervient dans le recrutement et la processivité de la télomérase.FUS lie le CTD de l'ARN polymérase II et régule sa phosphorylation à Ser2.26: 2690-95 (2012).Nature, 492: 285-289 (2012).


435 mots (1,1 pages)
Prédiction des gènes caractéristiques chez les patients traumatisés

[A1] 在figure legendså'ŒTableä¸ä½¿ç ”¨çš„ 是testing setï¼Œè¯ · ç »Ÿä¸ € è¯´æ³ • .[A5] æ · »åŠ åŽŸä½œè €… æˆ-è €… å‚ è € ƒæ- ‡ 献 .Qui a été déposé par ** * .Les termes Go avec FDR inférieur à 0,05 et les catégories KEGG avec une valeur inférieure à 0,05 ont été considérés comme significatifs.[A4] 对于 SVM评 ä¼ ° ç »“ æžœçš „sensibilité , spécificité, PPV, NPV è¿ ° .


2834 mots (7,1 pages)
Marqueurs de répétition de séquence simple dérivés d'une étiquette d'olive

Notre étude a montré un total de 93 voies différentes, dont 253 enzymes cibles par 381 amorces EST-SSR étaient des correspondances significatives dans la base de données KEGG, ces données peuvent Visualisation à l'aide du logiciel circos [38] .Ces amorces EST-SSR fournissent également des informations utiles pour comprendre les fonctions biologiques et les interactions entre les gènes en fonction de la localisation de ces amorces dans différentes voies liées à d'éventuelles différences phénotypiques entre les cultivars d'olive.Les marqueurs SSR sont très importants car ils sont co-dominants, hautement polymorphes et peuvent générer à partir de régions fonctionnelles du génome.Le programme blast2go contient également de nombreuses fonctio...


2380 mots (6,0 pages)
Caractérisation des HP à partir des interrogatoires de Leptospira

Nous sommes très reconnaissants de leur excellent soutien à tous égards.Les familles identifiées pour ces protéines hypothétiques sont impliquées dans les processus cellulaires normaux et la résistance aux médicaments.Prédictions physicochimiques faites pour des protéines hypothétiques, qui peuvent être utilisées pour trouver des agents thérapeutiques contre les infections causées par.Il aidera à l'étude de l'amarrage moléculaire pour le développement d'une cible puissante et efficace contre l'infection à Leptospira.Cette étude a été soutenue par le personnel académique de NIPER Guwahati.


1877 mots (4,7 pages)
Essai sur Miss Havisham dans de grandes attentes

11 juin 2015. .Oxford: Clarendon, 1996.Love's Madness: Medicine, the Novel, and Female Insanity."Miss Havisham's Objectification of Estella.""Bodies of Capital: Great Expectations and the Climacteric Economy."


450 mots (1,1 pages)
Petit ARN interférent Rédaction

Les pARNi peuvent être également couplés avec des molécules ayant une affinité avec certains récepteurs cellulaires situés spécifiquement sur les cellules d'un tissu visé.Ce dispositif ne permet cependant pas de cibler un organe particulier.Les deux morceaux du transcrit clivé par Ago vont être rapidement dégradés via leurs extrémités par des exonucléases.Par exemple, l'emploi d'un dérivé de l'N-acétylgalactosamine permet la fixation aux récepteurs à asialoglycoprotéines des hépatocytes...Plusieurs essais sont en cours chez l'être humain, avec pour cible l'apolipoprotéine(a), le PCSK9 ou la transthyrétine (avec le patisiran).


328 mots (0,8 pages)
Tarification Oligopole: vieilles idées et nouveaux outils

Figure SEQ Figure * ARABE 5: L'offre excédentaire de poulet sur le marché entraîne une faible demande et finit par baisser le prix.Figure SEQ Figure * ARABIC 3 ce graphique montre l'augmentation de la demande et du prix des carburants à haut rendement énergétique lorsque le prix pour l'essence augmente en raison de la fiscalité .Mason, OH: Apprentissage du Cengage du Sud-Ouest .Cambridge, Mass.Figure SEQ Figure * ARABE 6: (La taxe augmente le prix du tabac, entraînant une faible demande et finalement une faible consommation) .


1748 mots (4,4 pages)
Essai de questions et réponses sur l'économie

Figure SEQ Figure * ARABE 1: lorsque les gens s'attendent à des troubles civils, la demande est élevée mais les prix augmentent.Figure SEQ Figure * ARABIC 4: le graphique montre une diminution de la demande pour les voitures à haut rendement énergétique lorsque le prix de l'essence augmente .Figure SEQ Figure * ARABE 5: L'offre excédentaire de poulet sur le marché entraîne une faible demande et tombe finalement dans le prix.Figure SEQ Figure * ARABE 3 Ce graphique montre l'augmentation de la demande et du prix des carburants à haut rendement énergétique lorsque le prix de l'essence augmente en raison de la taxation .Figure SEQ Figure * ARABE 2: le prix de l'essence augmente lorsque la taxe est imposée .


1800 mots (4,5 pages)
Essai sur la télomérase Discovery

hopkinsmedicine.Dandjinou, At, Levesque, N, Larose, S, Lucier, JF, Abou-Elela, S, Wellinger RJ 2004, «A phylogenetic based secondary structure for the levure telomerase RNA» Current Biology, 14: 1148-1158.Chen, JL, Blasco, MA, Greider, CW 2000, Cellule «Secondary structure of vertebrate telomerase RNA», 100: 503-514.Tzfati, Y, Knight, Z, Roy, J, Blackburn, E H 2003, Un nouvel élément pseudoknot est essentiel pour l'action d'une télomérase de levure, Genes Development 17: 1779–1788.Vermolen, BJ, Garini, Y, Mai, S, Mougey, V, Fest, T, Chuang, TCY, Chuang, AYC, Wark, L, Young, IT 2005, 'Characterizing the Three-Dimensional Organization of Telomeres' Cytometry, 67A : 144-150.


1915 mots (4,8 pages)
Conclusion et implications managériales Essai

9 ANNEXE IX: Régression excluant les valeurs aberrantes résiduelles Analyse de régression: L'équation de régression est Pourcentage gagnant = 0.8% R-Sq (adj) = 45.7% Analyse de la variance Source DF SS MS FP Regression 5 0.7 ANNEXE VII: Analyse de régression avec cinq variables Analyse de régression L'équation de régression est Pourcentage gagnant = 0.0797903 R-Sq = 77.7% R-Sq (adj) = 75.9% Analyse de la variance Source DF SS MS FP Regression 5 1.8% Analyse de la variance Source DF SS MS FP Regression 6 1.


4461 mots (11,2 pages)
L'évaluation de la société dans les voyages de Jonathan Swift à Gulliver

2 juillet 2015. .Tuveson, Ernest.Gloucester, Mass: Peter Smith, 1965.Lock, F. P. The Politics of Gulliver's Travels.New York: Prentice-Hall, 1976.


3463 mots (8,7 pages)
Communication avec les parties prenantes, gestion de projet Exemples d'essais

Un système intégré aurait pu offrir un partage d'informations plus efficace et une notification immédiate des changements, plutôt que de compter sur l'équipe de projet ou les parties prenantes distribuant par courrier électronique.Les parties prenantes sont décrites comme des individus ou des groupes qui seront touchés par, ou peuvent influencer le succès ou l'échec ... .La fonction Opérations n'a besoin d'être informée qu'en cas d'impacts sur leur zone.... e source de communication.Cela a minimisé les intérêts concurrents et les influences négatives et a aidé le projet à respecter les délais.


496 mots (1,2 pages)

Vous n'avez pas trouvé ce que vous cherchiez?

Nous écrirons pour vous un essai sur un sujet donné pour 3 heures

Commandez!
× Nous utilisons des cookies pour vous offrir la meilleure expérience possible. En continuant, nous supposerons que vous êtes d'accord avec notre politique de cookies

Connectez-vous avec les médias sociaux